Nature:全新致癌机制,相分离驱动异常染色质成环,促进癌症拓展
2022-02-14 06:50 来源:金昌妇科医院
前列腺癌的发展与核酸细胞内内在无序区可定义(IDR)的基因组异常关的。各种细胞内(包括RNA甲基化、肝细胞内调节剂和RNA混合细胞)里面的IDR通过液-液相分立(LLPS)转变成汇聚器物,冲击从细胞内器转变成和刺激耐受到基因组RNA的无数生器物更进一步。
;也的液-液相分立(LLPS)是指糅合两个不相关基因组甲基化的更进一步。该更进一步愈演愈烈在细胞内核内,并并不需要转变成带有各种器天体物理学特功能性的可定义,这些可定义可以有助于前列腺癌,例如急功能性前列腺癌的愈演愈烈发展。在急功能性前列腺癌里面,核孔细胞(NUP98或NUP214)的连续不断生殖细胞易位产生了一种异常糅合体,它却是保留核孔细胞 IDR——甘氨酸和甘氨酸亚基(FG)的串联充分利用重复使用基因组序列。然而,IDR如何避免基因组错误抑制和愈演愈烈亦然不清楚。
2021年6月23日,北卡罗莱纳大学教堂山理工学院 Gang Greg Wang 开发团队等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究工作论文。
该研究工作说明了相分立是前列腺癌转变成的动力因素,前列腺癌通过相分立获得甲基化以设立致癌RNA甲基化汇聚器物,这同时减弱了它们的基因组序列核酸功能性并在裂解更进一步里面其会异常投影肝细胞内结构的转变成。该研究工作是最早将相分立与前列腺癌转变成联系起来的研究工作之一。因为在其他恶功能性里面辨别到了相同的基因组糅合,社论里面阐明的系统也可以解释其他特性的前列腺癌。
NUP98–HOXA9构成两个细胞内基序和一个混合基因组序列。为了研究工作NUP98-IDR在前列腺癌愈演愈烈里面的倚赖性,研究工作开发团队主要使用敲除了混合基因组序列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。
他们辨认出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏相-相分立汇聚体的化学器物质)处理过程尖锐。裂解的NUP98-IDR(N-IDR)细胞在体外转变成混合物汇聚器物。
为了进一步评量FG重复使用基因组序列对汇聚器物转变成的剂量倚赖功能性和多价功能性的重要功能性,研究工作开发团队合成了包含相同生产量FG重复使用基因组序列的重组N-IDR细胞内。他们辨认出N-IDR构成38个或36个FG以剂量倚赖功能性的方式则重复使用转变成的液滴,那些构成27个或11个FG的却不必进行相分立。表明NUP98–HOXA9里面的IDR以价倚赖和剂量倚赖的方式则设立LLPS。
NUP98–HOXA9通过同源结构可定义与DNA混合,避免前列腺癌愈演愈烈更进一步里面的基因组生理。再一,研究工作开发团队通过肝细胞内免疫沉淀和高通量DNA来评量IDR激活的相分立对NUP98–HOXA9肝细胞内核酸功能性的冲击。
结果表明, N-IDRWT/A9带有显着减弱的基因组序列普及率,而与无监理聚类假设的峰顶值亚类无关。此外,宽而密集的激减弱子样峰顶是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和前列腺癌相关基因组富集。
为了进一步评量IDR其会的LLPS在人口为120人体肝细胞内核酸里面的倚赖性,他们利用了生器物化学和药理学的方法,说明了IDR激活的LLPS在减弱人口为120人RNA甲基化核酸功能性方面的因果倚赖性,特别是在激减弱子样峰顶处看到的那些。表明IDR减弱糅合体的基因组序列混合并且减弱靶基因组抑制。
为了试验中NUP98–HOXA9通过LLPS转变成肝细胞内尿素的并能,研究工作开发团队生成了理解N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞内的Hi-C图说,揭示了DNA尿素和复制错综复杂的离地相关功能性。
为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C接触频率的冲击,他们聚集了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9理解细胞内里面500个最排斥的N-IDRWT/A9占据位点错综复杂的相互倚赖性计数。结果表明,N-IDRWT/A9尿素以基本上与CTCF无关的方式则转变成,与相分立动力系统相反。另外,N-IDRWT/A9特异功能性尿素重新相连减弱子和靶基因组错综复杂的相连,支持了糅合RNA甲基化的IDR通过相分立在激减弱子样机理和肿瘤组错综复杂其会DNA尿素的观点。
综上所述,该研究工作辨认出NUP98–HOXA9里面包含的LLPS活功能性IDR对前列腺癌的愈演愈烈和致肿瘤组理解计算机系统的抑制至关重要。这些效应由IDR的并能激活:1)减弱RNA甲基化与基因组序列机理的混合;2)有助于减弱子和肿瘤组启动子错综复杂的短距离尿素。
该研究工作包括了一个致癌甲基化的基本原理功能性证据,该甲基化在裂解更进一步里面有助于LLPS动力的RNA甲基化混合和3D肝细胞内重组。由于含IDR的LLPS活功能性分子与较广的前列腺癌有关,该研究工作阐明的系统也可以解释其他特性的前列腺癌。
值得注意出处:
Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.
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